17 Molecular techniques to identify and characterize candidate bacteria as potential probiotics-Ghithaiyate-blog
1. مقدمة:
في تدوينات سابقة تعرفنا على البريبايوتيك و خصائصه ومعاييره وأسس تصنيفه وعلى آليات عمله وعلى مخلفات تصنيعه وطرقها وقياسات تأثيره وعلى ماهية البروبيوتيك وكيفية عمله ومن يحتاجه؟ وعلى أنواع سلالات البروبيوتيك و على مصادر عزلها و متطلبات اختيارها وعلى الهيئات الرقابية لسلامة البروبيوتيك وما الفرق بين أطعمة البريبايوتيك البروبيوتيك؟ ومالفرق بين البريبايوتيك والألياف ؟ .كما تعرفنا على فوائد الأغذية المخمرة وعلى الكيفير وعلى تركيبه الميكروبي والتغذوي و على تحضيره منزليا وتجاريا وفوائده الصحية والتغذوية والتجميلية وعلى سلالات البروبيوتيك المستخدمة في علاج الأمراض الأيضية والقلب و الكبد والعصبية والنفسية و الأمراض التنفسية والفيروسية وأمراض القلب والأوعية.وفي هذه التدوينة سنتعرف على 17 تقنية جزيئية لتحديد وتوصيف البكتيريا المرشحة كبروبيوتيك محتمل
2. 17 تقنية جزيئية لتحديد وتوصيف البكتيريا المرشحة كبروبيوتيك محتمل
إن تحديد وتصنيف الميكروبات المفيدة له أهمية قصوى في علوم الأغذية والصناعات ذات الصلة. تطرح الأساليب المظهرية التقليدية العديد من التحديات، وقد تخطئ في تحديد الهدف، مما يحد من استخدامها. تُظهِر أدوات التنميط الجيني آفاقًا أفضل نسبيًا، وتُستخدم على نطاق واسع لتمييز الكائنات الحية الدقيقة. التقنيات المستخدمة بالفعل في التنميط الجيني لبكتيريا حمض اللاكتيك (LAB) تختلف قليلاً عن بعضها البعض، ولكل أداة مزاياها وعيوبها. يسرد الجدول أدناه العديد من أدوات أخذ البصمات التي تم استخدامها لتحديد وتوصيف LAB على مستوى الأنواع والأنواع الفرعية و السلالة. والجدير بالذكر أن معظم هذه الأساليب تعتمد على تقييد الهضم، والتضخيم باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل، والتسلسل. في الوقت الحاضر، حققت تقنيات تسلسل الحمض النووي تقدمًا كبيرًا من حيث التكلفة والإنتاجية والمنهجية. تستمر الرحلة البحثية لتطوير إصدارات محسنة من الأدوات القابلة للتطبيق بشكل عام والمجدية اقتصاديًا لتحليل الجزيئي والجينومي على مستوى العالم.
جدول تقنيات التنميط الجزيئية لتحديد وتوصيف البكتيريا
المرشحة كبروبيوتيك
محتمل |
||
م |
المختصر |
التقنية الجزيئية |
1 |
RT |
Ribotyping |
2 |
ARDRA |
Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis |
3 |
RAPD |
Random Amplified Polymorphic DNA |
4 |
AFLP |
Amplified Fragment Length Polymorphism |
5 |
PFGE |
Pulse Field Gel Electrophoresis |
6 |
Rep-PCR |
Repetitive Extragenic Palindromic PCR |
7 |
DGGE |
Denaturing (D) Gradient Gel Electrophoresis |
8 |
TGGE |
Temperature (T) Gradient Gel Electrophoresis |
9 |
T-RFLP |
Terminal (T)-Restriction Fragment Length Polymorphism |
10 |
MLST |
Multi-Locus Sequence Typing |
11 |
RT-PCR |
Real-Time PCR |
12 |
MA |
Microarrays |
13 |
MS |
Mass Spectrometry |
14 |
MALDI-TOF- MS |
Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization-Time of Flight MS |
15 |
LC- MS/MS |
Liquid Chromatography MS/MS |
16 |
TLC- MS/MS |
Targeted LC–MS/MS |
17 |
WGS |
Whole-Genome Sequencing |
تعليقات
إرسال تعليق